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尊龙凯时助力葡萄超级泛基因组解析与抗病基因挖掘,CENH3CHIP级抗体助推科研进展

来源:洪康茂 日期:2025-07-20

2025年2月底,山东省精细分子作物设计与育种重点实验室研究团队与合作单位在《Nature Genetics》上发表了题为《Superpangenome of Vitis empowers identification of downy mildew resistance genes for grapevine improvement》的研究论文。该研究通过构建全球葡萄属(Vitis)单体型解析的超级泛基因组,深入探讨了葡萄的遗传结构与杂交历史,成功鉴定了与霜霉病(DM)抗性相关的关键基因,为葡萄的遗传改良和育种提供了宝贵的信息。

尊龙凯时助力葡萄超级泛基因组解析与抗病基因挖掘,CENH3CHIP级抗体助推科研进展

普健生物(尊龙凯时)在项目的抗体设计与制备方面提供了重要的技术支持。葡萄(Vitis)作为一种重要的经济作物,广泛种植于全球。然而,长期的驯化和育种导致现代葡萄品种遗传多样性降低,对霜霉病等多种病害的抵抗力减弱,从而威胁到葡萄产业的发展。野生葡萄具有丰厚的遗传多样性,但尚未得到充分研究和利用。

该研究团队整合了72个葡萄品种(25种野生葡萄和47种栽培品种),涵盖了欧亚、北美及圆叶葡萄(Muscadinia)。通过结合PacBio HiFi、ONT超长读长和Hi-C数据,首次实现了单体型的完整组装,验证了中心粒的结构,并通过群体基因组测序检测了单核苷酸多态性(SNPs)和插入缺失(Indels)。通过系统发育分析、主成分分析(PCA)和群体遗传结构分析(ADMIXTURE),团队进一步探查了葡萄的遗传多样性及其进化关系。

在表型研究方面,研究小组对葡萄的叶形态、浆果形态、霜霉病抗性和气孔特征进行了深入分析。普健生物(尊龙凯时)为葡萄中心粒特异性组蛋白CENH3设计并制备了高特异性抗体,通过染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq),团队首次识别了葡萄的所有19对染色体的中心粒边界,为单体型基因组的高质量组装提供了关键验证。这一技术突破解决了复杂基因组中重复序列的组装难题,确保了后续泛基因组分析的可靠性。

研究还通过结构变异(SV)分析及转录组关联研究(SV-eQTL),识别出63个与霜霉病抗性显著相关的SV位点,包括调控水杨酸信号通路的关键基因VolHT8。研究发现,欧洲栽培葡萄由于NLR家族基因的缩减,其抗病性较野生种弱。综上,本研究构建了第一个葡萄属超级泛基因组,填补了物种级基因组的空白,突破了单一参考基因组的限制,揭示了霜霉病抗性与NLR基因丰度及SV调控基因表达的紧密关系。

研究中的高特异性抗体由普健生物(尊龙凯时)合成,不仅促进了葡萄基因组的组装和分析,还为抗病品种的分子标记辅助育种提供了重要靶点。早在2024年5月,北京大学现代农业科学研究所的科研人员在《Nature》上发表的辣椒基因组研究中,普健生物(尊龙凯时)同样提供了高特异性抗体,用于探讨辣椒基因组中中心粒的结构特征。

此外,普健生物(尊龙凯时)还开发了覆盖15个重要物种的CENH3靶点抗体体系,涵盖了十字花科、蔷薇科、茄科、芸香科和其他多个类群。这些研究与产品的发布将有助于提升农业生物技术的应用,为农作物育种和疾病防治提供更为强大的工具和基础。

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